欢迎来到北京博奥森生物技术有限公司网站!
为什么需要内参
WB是蛋白定性和定量的金标准,常应用于研究生物样品中蛋白丰度的变化。由于WB检测包含多个步骤,样品制备、上样或转膜等实验过程中任何细微的差异,都可能导致实验结论的不一致,甚至相悖。为了避免实验操作差异引起的实验误差,在任何WB检测实验中,都需要设定合适的内参。
内参即内部参照(Internal Control),可以帮助确定样品间表达水平的差异,以判断是由细胞裂解物的实际蛋白水平导致,还是由上样量的差异导致,需要强调的是内参抗体应该与实验抗体在相同的印迹上进行。因此选择的内参蛋白必须是实验样本中稳定表达的蛋白,一般会选择组成型表达且是细胞基本功能必需的管家蛋白(Housekeeping Proteins),如细胞骨架蛋白等。内参蛋白有多种选择,随机选择β-Actin或α-Tubulin作为内参并不能满足所有的WB实验,寻找合适的内参是特定WB成功的关键。
内参抗体选择原则
1. 样本来源:
(1)哺乳动物的组织或细胞样本:β-Actin、β-Tubulin、 GAPDH、 Lamin B1、PCNA、Histone H3等;
(2)植物样本:plant actin、Rubisco等;
(3)其他来源样本,参照已发表文献,选择合适蛋白作为内参。
2. 目的蛋白分子量:
选择内参抗体时,应该考虑目的蛋白分子量的大小,一般保证目的蛋白与内参蛋白分子量相差5kDa以上。例如,目的蛋白分子量为40kDa,此时不适宜选择β-actin与GAPDH作为内参,可以考虑选择α-Tubulin或者β-Tubulin。
各内参蛋白分子量详见下表

3. 目的蛋白定位:
(1)细胞质蛋白:β-Actin、β-Tubulin、α-Tubulin、GAPDH、Vinculin、Cyclophilin B等;
(2)细胞核蛋白:PCNA、Lamin A、Lamin B、Histone H3、K70、K80、Erk2、TATA binding protein (TBP)、c-Jun、c-Fos、YY1、HDAC1等;
(3)细胞膜蛋白:Na+/K+ ATPase等;
(4)细胞质膜蛋白:ATP1A1 (Sodium Potassium ATPase)等;
(5)线粒体蛋白:VDAC1、COXIV等;
(6)全血/血浆/血清:Transferrin、Albumin等。
4. 表达水平:
在特定实验条件下(如特殊的实验处理或不同的发育阶段),内参蛋白的表达水平相对于总蛋白需要保持恒定且高表达。常用的内参是由管家基因表达的,是细胞发育和维持细胞活力所必须的蛋白。例如,细胞核的内参蛋白PCNA,在DNA S期表达,因此对于非增殖细胞不推荐使用。
5. 丰度相似性:
实验样本中内参蛋白的表达丰度应与目的蛋白的丰度有相似性,实验方案和检测方法可以揭示内参蛋白和目标蛋白水平的变化,而不会出现信号饱和。如果内参蛋白的表达水平远远高于目的蛋白,必须对内参蛋白进行梯度稀释以确定内参蛋白的检测范围。
6. 表达因素:
(1)选择蛋白表达不受实验变量影响的内参,有研究表明,管家蛋白的表达有时并不恒定,会因实验条件的改变而改变。因此设计实验方案时应该考虑实际的实验因素并查询相应文献,在实验过程中也应该注意内参表达是否出现异常。
(2)在做多组织多细胞样本对比表达量时,最好选用GAPDH作为内参,因为GAPDH是代谢类蛋白,在活组织中表达比较恒定。而β-Actin和β-Tubulin是结构蛋白,不同组织的细胞结构会有差异性。
(3)在某些细胞中,由于组织缺氧、糖尿病等因素会导致GAPDH的表达增高,不适合做内参。
(4)涉及细胞增殖的相关实验中,c-Jun由于自身表达变化不适合做内参。
(5)在做凋亡实验时,TBP、Lamin等不适合作为内参。
(6)做诱导后样本或检测磷酸化等修饰性抗体时,应选择结构蛋白作为内参,如β-Actin和β-Tubulin。
(7)做各种分泌液样本的时候,如血浆、乳汁、组织液等,由于没有完整的细胞结构,只能选择一些分泌蛋白作为内参。
7. 验证内参抗体质量:
(1)阳性对照实验:用已知表达的样本验证抗体有效性。
(2)梯度上样验证:内参条带强度应与上样量呈线性关系。
(3)多内参交叉验证:高分文章标配,比如同时跑β-Actin和 GAPDH。
推荐产品
Bioss内参抗体包含不标记产品和标记产品,标记物包括Biotin、HRP、IRDye800、FITC、PE、Cy染料和AbBy Fluor ®染料等

Hu: Human; Mo: Mouse; Shp: Sheep; Rb: Rabbit; Chk: Chicken; Mk: Monkey ;Gpig: Guinea Pig; Hrs: Horse。
产品信息博奥森为准
验证数据









